疫情牽動著人們的心,病毒基因組測序分析工作尤為迫切。為支持北京市疫情防控技術(shù)需要,中國疾控中心病毒病所應(yīng)急技術(shù)中心在6月11日接收到北京市疾控中心送檢4份病例標(biāo)本后,馬上開展核酸檢測與基因組測序等應(yīng)急支撐工作,6月12日第一時間完成相關(guān)病例樣本病毒全基因組序列測定和分析工作,并及時報告給國家衛(wèi)健委及北京市相關(guān)部門,為北京新冠肺炎疫情防控與病毒溯源提供重要科技支撐。

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  這次中國疾控中心迅速完成病毒全基因組序列測定和分析工作,“中國CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測序工作站”發(fā)揮了重要作用。中國疾控中心病毒病所應(yīng)急技術(shù)中心主任譚文杰表示,基于團隊前期建立優(yōu)化的新冠全基因組測序技術(shù)方案,借助百度資助的先進測序儀,樣本接收后10個小時即完成了北京四個樣本的全基因組測序。這也是百度的AI大數(shù)據(jù)能力支持的“中國CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測序工作站”首戰(zhàn)告捷。

  為共同推動新冠肺炎病毒基因組分析與新型疫苗研究工作,今年4月,百度與中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議,雙方聯(lián)合設(shè)立“中國CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測序工作站”。同時,百度為該工作站配備了一整套先進的二代與三代測序設(shè)備平臺,并協(xié)商制定了全面開展新冠肺炎相關(guān)研究的合作計劃,基于百度研發(fā)的線性二級結(jié)構(gòu)預(yù)測算法LinearFold、mRNA疫苗二級結(jié)構(gòu)設(shè)計算法LinearDesign、Covseq新型冠狀病毒分析溯源可視化平臺等領(lǐng)先技術(shù),助力新冠肺炎相關(guān)研究,并長期支持公共衛(wèi)生相關(guān)科學(xué)研究。

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  疫情爆發(fā)以來,百度持續(xù)運用AI、大數(shù)據(jù)等前沿技術(shù)助力疫情防控。

  目前,百度研究院研發(fā)的線性二級結(jié)構(gòu)預(yù)測算法LinearFold已經(jīng)陸續(xù)在各基因檢測機構(gòu)、防疫中心及全世界科學(xué)研究中心投入應(yīng)用。LinearFold可將此次新型冠狀病毒的全基因組二級結(jié)構(gòu)預(yù)測從55分鐘縮短至27秒,提速120倍,節(jié)省了兩個數(shù)量級的等待時間,是RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域40年來第一次重大提速。1月30日,百度已向全球免費開放LinearFold算法及世界上現(xiàn)有最快的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測網(wǎng)站,以提升新型冠狀病毒RNA空間結(jié)構(gòu)預(yù)測速度。

  基于LinearFold算法,百度研究院5月推出全球首個mRNA疫苗基因序列設(shè)計算法LinearDesign,專門用于優(yōu)化mRNA序列設(shè)計的高效算法。LinearDesign能在16分鐘內(nèi)大大提升mRNA疫苗設(shè)計的穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)表達水平,大大加速疫苗研發(fā)速度。中國疾病預(yù)防控制中心后續(xù)將使用LinearDesign算法設(shè)計的mRNA疫苗序列進行體外實驗,驗證疫苗的穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)表達效率。

  當(dāng)下新型冠狀病毒還在持續(xù)變異中,對病毒進行監(jiān)控、溯源和研究追蹤對于了解疫情源頭,控制疫情傳播至關(guān)重要。百度也將持續(xù)和中國疾控中心病毒病所合作,以“中國CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測序工作站”為基地,提供包括病毒進化樹分析,病毒變異追蹤、溯源、可視化等一體化算法能力,幫助后者實現(xiàn)快速病毒測序,分析和監(jiān)控,共同推動新冠肺炎相關(guān)研究,早日戰(zhàn)勝疫情。